சுவாச நுண்ணுயிர்கள் என்பது நுரையீரல் நுண்ணுயிர் சமூகமாகும், இது கீழ் சுவாசக் குழாயில் குறிப்பாக சளி அடுக்கு மற்றும் எபிடெலியல் பரப்புகளில் காணப்படும் பல்வேறு நுண்ணுயிரிகளைக் கொண்டுள்ளது. இந்த நுண்ணுயிரிகளில் பாக்டீரியா, பூஞ்சை, வைரஸ்கள் மற்றும் பாக்டீரியோபேஜ்கள் அடங்கும். மைக்ரோபயோட்டாவின் பாக்டீரியா பகுதி மிகவும் நெருக்கமாக ஆய்வு செய்யப்பட்டுள்ளது. இது ஒன்பது வகைகளின் மையத்தைக் கொண்டுள்ளது: ப்ரீவோடெல்லா, ஸ்பிங்கோமோனாஸ், சூடோமோனாஸ், அசினெட்டோபாக்டர், ஃபுசோபாக்டீரியம், மெகாஸ்பேரா, வெயில்லோனெல்லா, ஸ்டேஃபிளோகோகஸ் மற்றும் ஸ்ட்ரெப்டோகாக்கஸ். அவை ஏரோப்ஸ் மற்றும் அனேரோப்ஸ் மற்றும் ஏரோடோலரண்ட் பாக்டீரியாக்கள். நுண்ணுயிர் சமூகங்கள் குறிப்பிட்ட நபர்களில் மிகவும் மாறுபடும் மற்றும் சுமார் 140 தனித்தனி குடும்பங்களை உருவாக்குகின்றன. உதாரணமாக, மூச்சுக்குழாய் மரத்தில் ஒரு சென்டிமீட்டர் சதுர பரப்பில் சராசரியாக 2000 பாக்டீரியா மரபணுக்கள் உள்ளன. தீங்கு விளைவிக்கும் அல்லது தீங்கு விளைவிக்கும் பாக்டீரியாக்கள் சுவாச மாதிரிகளில் வழக்கமாக கண்டறியப்படுகின்றன. மொராக்செல்லா கேடராலிஸ், ஹீமோபிலஸ் இன்ஃப்ளூயன்ஸா மற்றும் ஸ்ட்ரெப்டோகாக்கஸ் நிமோனியா ஆகியவை மிகவும் குறிப்பிடத்தக்கவை. மனித நோயெதிர்ப்பு அமைப்பு பலவீனமாக இருந்தால், அவை குறிப்பிட்ட நிலைமைகளின் கீழ் சுவாசக் கோளாறுகளை ஏற்படுத்துவதாக அறியப்படுகிறது. ஆரோக்கியமான நபர்களில் குறைந்த காற்றுப்பாதைகளில் அவை நிலைத்திருக்கும் வழிமுறை தெரியவில்லை. பொதுவாகக் காணப்படும் பூஞ்சை வகைகளானது நுரையீரலின் நுண்ணுயிரிகளில் நுரையீரல் மைக்கோபயோமை உருவாக்குகிறது, மேலும் கேண்டிடா, மலாசீசியா, நியோசார்டோரியா, சாக்கரோமைசஸ் மற்றும் அஸ்பெர்கிலஸ் போன்றவை அடங்கும்.