நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பி என்பது பாக்டீரியாவுக்கு எதிராக செயல்படும் ஒரு வகை நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பு பொருள் ஆகும். இது பாக்டீரியா நோய்த்தொற்றுகளை எதிர்த்துப் போராடுவதற்கான மிக முக்கியமான வகை பாக்டீரியா எதிர்ப்பு முகவராகும், மேலும் இத்தகைய நோய்த்தொற்றுகளின் சிகிச்சையிலும் தடுப்பிலும் ஆண்டிபயாடிக் மருந்துகள் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. அவை பாக்டீரியாவின் வளர்ச்சியைக் கொல்லலாம் அல்லது தடுக்கலாம். குறிப்பிட்ட எண்ணிக்கையிலான நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பிகள் ஆன்டிபிரோடோசோல் செயல்பாட்டையும் கொண்டுள்ளன. ஜலதோஷம் அல்லது காய்ச்சல் போன்ற வைரஸ்களுக்கு எதிராக நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பிகள் பயனுள்ளதாக இல்லை; வைரஸ்களின் வளர்ச்சியைத் தடுக்கும் மருந்துகள் நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பிகளைக் காட்டிலும் வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகள் அல்லது ஆன்டிவைரல்கள் என்று அழைக்கப்படுகின்றன. அவை பூஞ்சைகளுக்கு எதிராகவும் செயல்படாது; பூஞ்சைகளின் வளர்ச்சியைத் தடுக்கும் மருந்துகள் பூஞ்சை எதிர்ப்பு மருந்துகள் என்று அழைக்கப்படுகின்றன.